Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNA2P20248 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNA2P20248 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNA2P20248 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNA2P20248 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNA2P20248 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms