Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HLA-DPA1P20036 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HLA-DPA1P20036 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HLA-DPA1P20036 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HLA-DPA1P20036 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HLA-DPA1P20036 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms