Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCF2P19878 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NCF2P19878 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NCF2P19878 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NCF2P19878 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NCF2P19878 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCF2P19878 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NCF2P19878 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCF2P19878 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCF2P19878 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NCF2P19878 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCF2P19878 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NCF2P19878 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCF2P19878 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NCF2P19878 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NCF2P19878 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCF2P19878 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCF2P19878 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NCF2P19878 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCF2P19878 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCF2P19878 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NCF2P19878 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NCF2P19878 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCF2P19878 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCF2P19878 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCF2P19878 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCF2P19878 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCF2P19878 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCF2P19878 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCF2P19878 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCF2P19878 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCF2P19878 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCF2P19878 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCF2P19878 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCF2P19878 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCF2P19878 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCF2P19878 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NCF2P19878 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCF2P19878 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCF2P19878 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCF2P19878 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCF2P19878 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCF2P19878 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCF2P19878 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCF2P19878 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCF2P19878 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCF2P19878 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCF2P19878 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NCF2P19878 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCF2P19878 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCF2P19878 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCF2P19878 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCF2P19878 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCF2P19878 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCF2P19878 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCF2P19878 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCF2P19878 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCF2P19878 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCF2P19878 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCF2P19878 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCF2P19878 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCF2P19878 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCF2P19878 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCF2P19878 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCF2P19878 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCF2P19878 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCF2P19878 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCF2P19878 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCF2P19878 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCF2P19878 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCF2P19878 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCF2P19878 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCF2P19878 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCF2P19878 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCF2P19878 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCF2P19878 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCF2P19878 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCF2P19878 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCF2P19878 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCF2P19878 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCF2P19878 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCF2P19878 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCF2P19878 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCF2P19878 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCF2P19878 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCF2P19878 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCF2P19878 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCF2P19878 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCF2P19878 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCF2P19878 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCF2P19878 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCF2P19878 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCF2P19878 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCF2P19878 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCF2P19878 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCF2P19878 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCF2P19878 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCF2P19878 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCF2P19878 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCF2P19878 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms