Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KCNA6P17658 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KCNA6P17658 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KCNA6P17658 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
KCNA6P17658 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
KCNA6P17658 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
KCNA6P17658 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC37.83■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
KCNA6P17658 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
KCNA6P17658 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.74■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
KCNA6P17658 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
KCNA6P17658 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
KCNA6P17658 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.54■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
KCNA6P17658 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
KCNA6P17658 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
KCNA6P17658 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
KCNA6P17658 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms