Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB6P17509 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HOXB6P17509 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXB6P17509 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXB6P17509 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXB6P17509 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HOXB6P17509 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXB6P17509 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms