Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF43P17038 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF43P17038 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF43P17038 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF43P17038 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF43P17038 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF43P17038 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF43P17038 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF43P17038 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNF43P17038 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF43P17038 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNF43P17038 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF43P17038 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF43P17038 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF43P17038 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF43P17038 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF43P17038 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms