Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPB42P16452 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPB42P16452 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPB42P16452 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPB42P16452 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPB42P16452 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPB42P16452 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPB42P16452 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPB42P16452 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPB42P16452 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EPB42P16452 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPB42P16452 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPB42P16452 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPB42P16452 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPB42P16452 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPB42P16452 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPB42P16452 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPB42P16452 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPB42P16452 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPB42P16452 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPB42P16452 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPB42P16452 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPB42P16452 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPB42P16452 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPB42P16452 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPB42P16452 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPB42P16452 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPB42P16452 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPB42P16452 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPB42P16452 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPB42P16452 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPB42P16452 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EPB42P16452 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPB42P16452 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPB42P16452 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPB42P16452 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPB42P16452 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPB42P16452 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB42P16452 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB42P16452 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB42P16452 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB42P16452 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB42P16452 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB42P16452 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB42P16452 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB42P16452 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPB42P16452 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPB42P16452 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPB42P16452 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB42P16452 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPB42P16452 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPB42P16452 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPB42P16452 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB42P16452 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB42P16452 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB42P16452 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB42P16452 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB42P16452 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB42P16452 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB42P16452 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB42P16452 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB42P16452 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB42P16452 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB42P16452 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB42P16452 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB42P16452 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB42P16452 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB42P16452 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB42P16452 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB42P16452 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB42P16452 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB42P16452 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB42P16452 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB42P16452 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB42P16452 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB42P16452 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB42P16452 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB42P16452 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB42P16452 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EPB42P16452 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB42P16452 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB42P16452 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB42P16452 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EPB42P16452 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EPB42P16452 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB42P16452 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB42P16452 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB42P16452 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EPB42P16452 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB42P16452 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB42P16452 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EPB42P16452 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB42P16452 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EPB42P16452 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB42P16452 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EPB42P16452 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EPB42P16452 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB42P16452 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB42P16452 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EPB42P16452 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms