Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CHN1P15882 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CHN1P15882 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CHN1P15882 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CHN1P15882 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHN1P15882 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHN1P15882 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CHN1P15882 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHN1P15882 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CHN1P15882 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHN1P15882 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHN1P15882 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CHN1P15882 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHN1P15882 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CHN1P15882 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CHN1P15882 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CHN1P15882 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHN1P15882 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHN1P15882 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CHN1P15882 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHN1P15882 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHN1P15882 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHN1P15882 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CHN1P15882 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHN1P15882 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHN1P15882 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHN1P15882 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHN1P15882 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHN1P15882 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CHN1P15882 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHN1P15882 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHN1P15882 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CHN1P15882 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHN1P15882 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CHN1P15882 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHN1P15882 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHN1P15882 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CHN1P15882 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHN1P15882 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CHN1P15882 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHN1P15882 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CHN1P15882 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CHN1P15882 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHN1P15882 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHN1P15882 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHN1P15882 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHN1P15882 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHN1P15882 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CHN1P15882 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CHN1P15882 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHN1P15882 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CHN1P15882 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHN1P15882 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHN1P15882 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHN1P15882 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CHN1P15882 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHN1P15882 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CHN1P15882 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHN1P15882 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CHN1P15882 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHN1P15882 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CHN1P15882 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHN1P15882 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHN1P15882 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHN1P15882 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CHN1P15882 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHN1P15882 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CHN1P15882 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHN1P15882 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHN1P15882 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CHN1P15882 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHN1P15882 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHN1P15882 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CHN1P15882 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHN1P15882 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHN1P15882 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CHN1P15882 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CHN1P15882 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHN1P15882 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHN1P15882 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CHN1P15882 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHN1P15882 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHN1P15882 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHN1P15882 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHN1P15882 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHN1P15882 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHN1P15882 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHN1P15882 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHN1P15882 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHN1P15882 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHN1P15882 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHN1P15882 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHN1P15882 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHN1P15882 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHN1P15882 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHN1P15882 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHN1P15882 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHN1P15882 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHN1P15882 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHN1P15882 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms