Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FDPSP14324 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FDPSP14324 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FDPSP14324 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FDPSP14324 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FDPSP14324 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FDPSP14324 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FDPSP14324 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FDPSP14324 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FDPSP14324 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FDPSP14324 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FDPSP14324 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FDPSP14324 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FDPSP14324 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FDPSP14324 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FDPSP14324 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FDPSP14324 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FDPSP14324 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FDPSP14324 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FDPSP14324 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FDPSP14324 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FDPSP14324 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FDPSP14324 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FDPSP14324 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FDPSP14324 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
FDPSP14324 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FDPSP14324 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FDPSP14324 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FDPSP14324 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FDPSP14324 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FDPSP14324 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FDPSP14324 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FDPSP14324 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FDPSP14324 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FDPSP14324 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FDPSP14324 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FDPSP14324 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FDPSP14324 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FDPSP14324 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FDPSP14324 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FDPSP14324 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FDPSP14324 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FDPSP14324 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FDPSP14324 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FDPSP14324 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FDPSP14324 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FDPSP14324 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FDPSP14324 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FDPSP14324 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FDPSP14324 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FDPSP14324 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FDPSP14324 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FDPSP14324 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
FDPSP14324 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FDPSP14324 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FDPSP14324 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FDPSP14324 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FDPSP14324 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FDPSP14324 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FDPSP14324 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
FDPSP14324 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
FDPSP14324 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
FDPSP14324 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FDPSP14324 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FDPSP14324 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
FDPSP14324 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FDPSP14324 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FDPSP14324 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FDPSP14324 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FDPSP14324 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FDPSP14324 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FDPSP14324 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
FDPSP14324 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FDPSP14324 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FDPSP14324 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FDPSP14324 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FDPSP14324 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FDPSP14324 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
FDPSP14324 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
FDPSP14324 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FDPSP14324 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FDPSP14324 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FDPSP14324 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FDPSP14324 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FDPSP14324 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FDPSP14324 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FDPSP14324 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FDPSP14324 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
FDPSP14324 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FDPSP14324 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FDPSP14324 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FDPSP14324 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FDPSP14324 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FDPSP14324 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FDPSP14324 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FDPSP14324 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FDPSP14324 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
FDPSP14324 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
FDPSP14324 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FDPSP14324 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms