Protein–RNA interactions for Protein: P14209

CD99, CD99 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99P14209 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD99P14209 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD99P14209 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD99P14209 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD99P14209 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD99P14209 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD99P14209 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD99P14209 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD99P14209 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD99P14209 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD99P14209 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD99P14209 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD99P14209 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD99P14209 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD99P14209 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD99P14209 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD99P14209 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD99P14209 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD99P14209 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD99P14209 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD99P14209 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD99P14209 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD99P14209 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD99P14209 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD99P14209 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD99P14209 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD99P14209 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD99P14209 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD99P14209 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CD99P14209 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD99P14209 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD99P14209 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD99P14209 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD99P14209 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD99P14209 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD99P14209 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD99P14209 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD99P14209 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD99P14209 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD99P14209 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD99P14209 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD99P14209 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD99P14209 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD99P14209 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD99P14209 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD99P14209 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD99P14209 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD99P14209 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD99P14209 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD99P14209 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD99P14209 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD99P14209 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD99P14209 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD99P14209 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD99P14209 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD99P14209 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD99P14209 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD99P14209 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD99P14209 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD99P14209 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD99P14209 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD99P14209 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD99P14209 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD99P14209 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD99P14209 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD99P14209 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD99P14209 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD99P14209 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD99P14209 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD99P14209 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD99P14209 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD99P14209 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD99P14209 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD99P14209 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD99P14209 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD99P14209 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD99P14209 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD99P14209 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD99P14209 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD99P14209 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CD99P14209 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD99P14209 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD99P14209 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD99P14209 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD99P14209 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD99P14209 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD99P14209 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CD99P14209 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD99P14209 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD99P14209 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD99P14209 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD99P14209 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD99P14209 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD99P14209 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD99P14209 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD99P14209 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD99P14209 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD99P14209 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD99P14209 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD99P14209 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms