Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HLA-EP13747 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-EP13747 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HLA-EP13747 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-EP13747 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-EP13747 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HLA-EP13747 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-EP13747 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-EP13747 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HLA-EP13747 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-EP13747 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-EP13747 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-EP13747 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-EP13747 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-EP13747 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-EP13747 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-EP13747 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-EP13747 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HLA-EP13747 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HLA-EP13747 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-EP13747 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-EP13747 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-EP13747 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-EP13747 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-EP13747 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-EP13747 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HLA-EP13747 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HLA-EP13747 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms