Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEACAM1P13688 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CEACAM1P13688 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CEACAM1P13688 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEACAM1P13688 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEACAM1P13688 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEACAM1P13688 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEACAM1P13688 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEACAM1P13688 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEACAM1P13688 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CEACAM1P13688 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEACAM1P13688 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CEACAM1P13688 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEACAM1P13688 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEACAM1P13688 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEACAM1P13688 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEACAM1P13688 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CEACAM1P13688 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEACAM1P13688 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEACAM1P13688 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEACAM1P13688 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEACAM1P13688 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms