Protein–RNA interactions for Protein: P13056

NR2C1, Nuclear receptor subfamily 2 group C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2C1P13056 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NR2C1P13056 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR2C1P13056 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR2C1P13056 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR2C1P13056 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR2C1P13056 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR2C1P13056 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NR2C1P13056 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NR2C1P13056 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR2C1P13056 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NR2C1P13056 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NR2C1P13056 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NR2C1P13056 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms