Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK4P11802 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDK4P11802 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK4P11802 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK4P11802 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK4P11802 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK4P11802 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK4P11802 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDK4P11802 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK4P11802 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK4P11802 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK4P11802 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDK4P11802 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK4P11802 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDK4P11802 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDK4P11802 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK4P11802 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK4P11802 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDK4P11802 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK4P11802 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK4P11802 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDK4P11802 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDK4P11802 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK4P11802 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK4P11802 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK4P11802 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDK4P11802 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK4P11802 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDK4P11802 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK4P11802 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDK4P11802 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK4P11802 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK4P11802 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK4P11802 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDK4P11802 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDK4P11802 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK4P11802 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK4P11802 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK4P11802 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CDK4P11802 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK4P11802 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK4P11802 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK4P11802 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK4P11802 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDK4P11802 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDK4P11802 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK4P11802 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK4P11802 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDK4P11802 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK4P11802 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK4P11802 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK4P11802 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK4P11802 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK4P11802 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK4P11802 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK4P11802 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK4P11802 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK4P11802 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK4P11802 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK4P11802 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK4P11802 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK4P11802 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK4P11802 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK4P11802 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK4P11802 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK4P11802 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK4P11802 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK4P11802 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK4P11802 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK4P11802 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK4P11802 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK4P11802 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK4P11802 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK4P11802 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK4P11802 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK4P11802 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK4P11802 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK4P11802 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK4P11802 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK4P11802 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK4P11802 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK4P11802 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK4P11802 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK4P11802 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK4P11802 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK4P11802 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK4P11802 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK4P11802 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK4P11802 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK4P11802 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK4P11802 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK4P11802 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK4P11802 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK4P11802 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK4P11802 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK4P11802 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK4P11802 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK4P11802 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK4P11802 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK4P11802 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.7 ms