Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SFTPCP11686 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SFTPCP11686 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SFTPCP11686 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFTPCP11686 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SFTPCP11686 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFTPCP11686 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SFTPCP11686 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFTPCP11686 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFTPCP11686 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFTPCP11686 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFTPCP11686 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SFTPCP11686 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SFTPCP11686 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFTPCP11686 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SFTPCP11686 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFTPCP11686 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SFTPCP11686 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SFTPCP11686 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFTPCP11686 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SFTPCP11686 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SFTPCP11686 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SFTPCP11686 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SFTPCP11686 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFTPCP11686 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SFTPCP11686 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFTPCP11686 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SFTPCP11686 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFTPCP11686 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFTPCP11686 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFTPCP11686 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SFTPCP11686 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms