Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CD8BP10966 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD8BP10966 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8BP10966 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8BP10966 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8BP10966 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8BP10966 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8BP10966 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD8BP10966 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD8BP10966 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD8BP10966 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD8BP10966 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD8BP10966 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD8BP10966 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD8BP10966 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD8BP10966 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD8BP10966 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD8BP10966 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CD8BP10966 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD8BP10966 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CD8BP10966 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD8BP10966 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD8BP10966 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD8BP10966 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD8BP10966 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD8BP10966 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD8BP10966 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CD8BP10966 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD8BP10966 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CD8BP10966 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD8BP10966 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD8BP10966 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD8BP10966 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD8BP10966 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD8BP10966 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD8BP10966 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD8BP10966 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD8BP10966 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD8BP10966 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8BP10966 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8BP10966 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8BP10966 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8BP10966 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8BP10966 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8BP10966 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD8BP10966 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD8BP10966 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD8BP10966 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD8BP10966 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD8BP10966 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD8BP10966 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD8BP10966 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD8BP10966 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD8BP10966 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD8BP10966 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD8BP10966 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD8BP10966 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD8BP10966 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD8BP10966 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD8BP10966 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD8BP10966 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD8BP10966 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD8BP10966 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD8BP10966 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD8BP10966 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD8BP10966 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD8BP10966 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD8BP10966 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD8BP10966 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD8BP10966 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD8BP10966 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD8BP10966 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD8BP10966 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD8BP10966 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD8BP10966 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD8BP10966 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD8BP10966 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8BP10966 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8BP10966 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8BP10966 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8BP10966 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD8BP10966 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD8BP10966 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD8BP10966 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD8BP10966 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD8BP10966 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD8BP10966 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD8BP10966 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD8BP10966 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD8BP10966 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD8BP10966 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD8BP10966 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD8BP10966 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD8BP10966 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8BP10966 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8BP10966 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8BP10966 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8BP10966 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8BP10966 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD8BP10966 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms