Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
THRAP10827 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
THRAP10827 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THRAP10827 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
THRAP10827 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP10827 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP10827 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
THRAP10827 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THRAP10827 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
THRAP10827 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
THRAP10827 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP10827 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP10827 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP10827 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP10827 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP10827 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THRAP10827 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THRAP10827 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP10827 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP10827 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THRAP10827 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP10827 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP10827 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP10827 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
THRAP10827 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP10827 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP10827 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP10827 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP10827 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THRAP10827 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP10827 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP10827 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP10827 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRAP10827 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THRAP10827 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THRAP10827 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THRAP10827 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
THRAP10827 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THRAP10827 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
THRAP10827 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THRAP10827 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP10827 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP10827 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THRAP10827 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP10827 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP10827 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP10827 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THRAP10827 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
THRAP10827 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
THRAP10827 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THRAP10827 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THRAP10827 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THRAP10827 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
THRAP10827 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THRAP10827 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
THRAP10827 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THRAP10827 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THRAP10827 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THRAP10827 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THRAP10827 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THRAP10827 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THRAP10827 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THRAP10827 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THRAP10827 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THRAP10827 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
THRAP10827 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THRAP10827 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
THRAP10827 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
THRAP10827 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP10827 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP10827 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP10827 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP10827 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRAP10827 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP10827 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP10827 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP10827 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP10827 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRAP10827 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP10827 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRAP10827 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP10827 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP10827 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP10827 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP10827 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP10827 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THRAP10827 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP10827 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP10827 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP10827 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRAP10827 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP10827 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP10827 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP10827 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
THRAP10827 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP10827 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP10827 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP10827 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRAP10827 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRAP10827 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms