Protein–RNA interactions for Protein: P0DMP2

SRGAP2B, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2BP0DMP2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP2BP0DMP2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SRGAP2BP0DMP2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRGAP2BP0DMP2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRGAP2BP0DMP2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRGAP2BP0DMP2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP2BP0DMP2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP2BP0DMP2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP2BP0DMP2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRGAP2BP0DMP2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGAP2BP0DMP2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGAP2BP0DMP2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRGAP2BP0DMP2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRGAP2BP0DMP2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRGAP2BP0DMP2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP2BP0DMP2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRGAP2BP0DMP2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRGAP2BP0DMP2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SRGAP2BP0DMP2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRGAP2BP0DMP2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms