Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC166P0CW27 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC166P0CW27 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC166P0CW27 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC166P0CW27 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC166P0CW27 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC166P0CW27 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC166P0CW27 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC166P0CW27 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC166P0CW27 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms