Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00869P0C866 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00869P0C866 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LINC00869P0C866 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LINC00869P0C866 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00869P0C866 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LINC00869P0C866 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00869P0C866 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LINC00869P0C866 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LINC00869P0C866 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LINC00869P0C866 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
LINC00869P0C866 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINC00869P0C866 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LINC00869P0C866 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LINC00869P0C866 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms