Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSL3P1P0C860 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MSL3P1P0C860 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MSL3P1P0C860 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MSL3P1P0C860 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3P1P0C860 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3P1P0C860 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3P1P0C860 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MSL3P1P0C860 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MSL3P1P0C860 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSL3P1P0C860 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MSL3P1P0C860 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSL3P1P0C860 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MSL3P1P0C860 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MSL3P1P0C860 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MSL3P1P0C860 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3P1P0C860 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3P1P0C860 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3P1P0C860 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSL3P1P0C860 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3P1P0C860 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSL3P1P0C860 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSL3P1P0C860 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MSL3P1P0C860 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3P1P0C860 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3P1P0C860 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MSL3P1P0C860 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSL3P1P0C860 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSL3P1P0C860 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MSL3P1P0C860 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3P1P0C860 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3P1P0C860 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3P1P0C860 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3P1P0C860 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3P1P0C860 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MSL3P1P0C860 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MSL3P1P0C860 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MSL3P1P0C860 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms