Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z6

TFPT, TCF3 fusion partner, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFPTP0C1Z6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TFPTP0C1Z6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TFPTP0C1Z6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TFPTP0C1Z6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TFPTP0C1Z6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFPTP0C1Z6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFPTP0C1Z6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms