Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF3P09919 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF3P09919 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF3P09919 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSF3P09919 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF3P09919 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF3P09919 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF3P09919 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSF3P09919 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF3P09919 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSF3P09919 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF3P09919 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF3P09919 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CSF3P09919 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF3P09919 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSF3P09919 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF3P09919 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF3P09919 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF3P09919 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF3P09919 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF3P09919 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSF3P09919 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF3P09919 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSF3P09919 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF3P09919 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF3P09919 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF3P09919 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSF3P09919 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF3P09919 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF3P09919 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF3P09919 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF3P09919 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CSF3P09919 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF3P09919 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF3P09919 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF3P09919 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSF3P09919 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSF3P09919 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CSF3P09919 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF3P09919 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CSF3P09919 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CSF3P09919 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF3P09919 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF3P09919 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSF3P09919 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF3P09919 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF3P09919 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF3P09919 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF3P09919 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF3P09919 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF3P09919 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSF3P09919 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF3P09919 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF3P09919 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSF3P09919 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF3P09919 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF3P09919 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSF3P09919 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF3P09919 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF3P09919 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF3P09919 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSF3P09919 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF3P09919 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF3P09919 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF3P09919 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF3P09919 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF3P09919 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF3P09919 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSF3P09919 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF3P09919 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF3P09919 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF3P09919 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF3P09919 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSF3P09919 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF3P09919 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CSF3P09919 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF3P09919 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF3P09919 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF3P09919 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF3P09919 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF3P09919 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSF3P09919 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF3P09919 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF3P09919 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSF3P09919 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF3P09919 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF3P09919 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF3P09919 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF3P09919 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSF3P09919 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF3P09919 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF3P09919 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF3P09919 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF3P09919 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSF3P09919 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF3P09919 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF3P09919 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSF3P09919 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF3P09919 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSF3P09919 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms