Protein–RNA interactions for Protein: P09455

RBP1, Retinol-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP1P09455 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBP1P09455 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RBP1P09455 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RBP1P09455 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBP1P09455 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RBP1P09455 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBP1P09455 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBP1P09455 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBP1P09455 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBP1P09455 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBP1P09455 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBP1P09455 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBP1P09455 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBP1P09455 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBP1P09455 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBP1P09455 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBP1P09455 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBP1P09455 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBP1P09455 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBP1P09455 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBP1P09455 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBP1P09455 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBP1P09455 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBP1P09455 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBP1P09455 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBP1P09455 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBP1P09455 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBP1P09455 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RBP1P09455 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RBP1P09455 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBP1P09455 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBP1P09455 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBP1P09455 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBP1P09455 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBP1P09455 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RBP1P09455 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBP1P09455 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBP1P09455 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBP1P09455 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBP1P09455 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RBP1P09455 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBP1P09455 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RBP1P09455 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBP1P09455 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBP1P09455 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RBP1P09455 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RBP1P09455 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBP1P09455 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RBP1P09455 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBP1P09455 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBP1P09455 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RBP1P09455 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBP1P09455 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBP1P09455 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RBP1P09455 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBP1P09455 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBP1P09455 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBP1P09455 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBP1P09455 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RBP1P09455 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBP1P09455 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RBP1P09455 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBP1P09455 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBP1P09455 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RBP1P09455 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBP1P09455 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RBP1P09455 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBP1P09455 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RBP1P09455 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RBP1P09455 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RBP1P09455 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBP1P09455 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RBP1P09455 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBP1P09455 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBP1P09455 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBP1P09455 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RBP1P09455 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBP1P09455 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBP1P09455 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RBP1P09455 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBP1P09455 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RBP1P09455 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RBP1P09455 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBP1P09455 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RBP1P09455 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBP1P09455 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBP1P09455 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBP1P09455 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RBP1P09455 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RBP1P09455 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBP1P09455 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBP1P09455 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBP1P09455 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBP1P09455 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RBP1P09455 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RBP1P09455 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP1P09455 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP1P09455 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP1P09455 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RBP1P09455 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms