Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP1P09430 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP1P09430 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP1P09430 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TNP1P09430 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
TNP1P09430 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP1P09430 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP1P09430 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP1P09430 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP1P09430 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP1P09430 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TNP1P09430 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP1P09430 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP1P09430 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP1P09430 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TNP1P09430 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP1P09430 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP1P09430 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP1P09430 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP1P09430 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP1P09430 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TNP1P09430 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP1P09430 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP1P09430 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP1P09430 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP1P09430 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TNP1P09430 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP1P09430 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP1P09430 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP1P09430 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP1P09430 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP1P09430 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP1P09430 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP1P09430 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP1P09430 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP1P09430 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP1P09430 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP1P09430 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TNP1P09430 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP1P09430 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP1P09430 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP1P09430 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP1P09430 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP1P09430 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP1P09430 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNP1P09430 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP1P09430 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP1P09430 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP1P09430 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP1P09430 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP1P09430 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP1P09430 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP1P09430 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP1P09430 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TNP1P09430 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP1P09430 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP1P09430 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TNP1P09430 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TNP1P09430 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP1P09430 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP1P09430 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP1P09430 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP1P09430 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
TNP1P09430 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP1P09430 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP1P09430 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP1P09430 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP1P09430 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP1P09430 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP1P09430 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP1P09430 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
TNP1P09430 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP1P09430 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP1P09430 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP1P09430 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP1P09430 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP1P09430 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP1P09430 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP1P09430 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP1P09430 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
TNP1P09430 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TNP1P09430 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP1P09430 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP1P09430 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP1P09430 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TNP1P09430 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP1P09430 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP1P09430 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP1P09430 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TNP1P09430 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP1P09430 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP1P09430 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP1P09430 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP1P09430 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP1P09430 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP1P09430 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TNP1P09430 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP1P09430 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP1P09430 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TNP1P09430 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms