Protein–RNA interactions for Protein: P08908

HTR1A, 5-hydroxytryptamine receptor 1A, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1AP08908 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTR1AP08908 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1AP08908 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1AP08908 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR1AP08908 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HTR1AP08908 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HTR1AP08908 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms