Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ABCB1P08183 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABCB1P08183 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB1P08183 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABCB1P08183 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB1P08183 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABCB1P08183 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABCB1P08183 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB1P08183 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ABCB1P08183 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB1P08183 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ABCB1P08183 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ABCB1P08183 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ABCB1P08183 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ABCB1P08183 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 269.8 ms