Protein–RNA interactions for Protein: P06028

GYPB, Glycophorin-B, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPBP06028 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYPBP06028 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GYPBP06028 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPBP06028 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPBP06028 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPBP06028 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GYPBP06028 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPBP06028 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPBP06028 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPBP06028 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GYPBP06028 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPBP06028 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPBP06028 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPBP06028 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPBP06028 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GYPBP06028 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYPBP06028 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GYPBP06028 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPBP06028 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPBP06028 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPBP06028 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPBP06028 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPBP06028 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GYPBP06028 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYPBP06028 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYPBP06028 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GYPBP06028 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYPBP06028 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYPBP06028 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYPBP06028 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYPBP06028 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYPBP06028 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYPBP06028 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GYPBP06028 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GYPBP06028 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GYPBP06028 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GYPBP06028 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GYPBP06028 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GYPBP06028 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GYPBP06028 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GYPBP06028 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GYPBP06028 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GYPBP06028 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GYPBP06028 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GYPBP06028 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYPBP06028 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYPBP06028 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYPBP06028 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GYPBP06028 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYPBP06028 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYPBP06028 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GYPBP06028 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GYPBP06028 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GYPBP06028 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GYPBP06028 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GYPBP06028 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GYPBP06028 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GYPBP06028 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GYPBP06028 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GYPBP06028 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GYPBP06028 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GYPBP06028 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GYPBP06028 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GYPBP06028 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GYPBP06028 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GYPBP06028 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GYPBP06028 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GYPBP06028 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYPBP06028 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYPBP06028 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GYPBP06028 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GYPBP06028 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GYPBP06028 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GYPBP06028 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GYPBP06028 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GYPBP06028 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GYPBP06028 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GYPBP06028 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GYPBP06028 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GYPBP06028 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GYPBP06028 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GYPBP06028 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GYPBP06028 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GYPBP06028 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GYPBP06028 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GYPBP06028 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GYPBP06028 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GYPBP06028 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYPBP06028 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYPBP06028 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYPBP06028 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYPBP06028 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GYPBP06028 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYPBP06028 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GYPBP06028 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYPBP06028 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYPBP06028 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYPBP06028 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GYPBP06028 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GYPBP06028 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms