Protein–RNA interactions for Protein: P05783

KRT18, Keratin, type I cytoskeletal 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT18P05783 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT18P05783 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KRT18P05783 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT18P05783 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT18P05783 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT18P05783 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KRT18P05783 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT18P05783 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT18P05783 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT18P05783 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT18P05783 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KRT18P05783 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT18P05783 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT18P05783 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT18P05783 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KRT18P05783 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT18P05783 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KRT18P05783 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT18P05783 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KRT18P05783 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT18P05783 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT18P05783 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KRT18P05783 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT18P05783 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT18P05783 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT18P05783 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KRT18P05783 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT18P05783 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT18P05783 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT18P05783 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
KRT18P05783 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT18P05783 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT18P05783 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KRT18P05783 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT18P05783 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT18P05783 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KRT18P05783 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
KRT18P05783 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT18P05783 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT18P05783 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT18P05783 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT18P05783 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT18P05783 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KRT18P05783 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT18P05783 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT18P05783 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT18P05783 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
KRT18P05783 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT18P05783 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT18P05783 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT18P05783 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT18P05783 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT18P05783 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT18P05783 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT18P05783 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT18P05783 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT18P05783 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT18P05783 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT18P05783 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT18P05783 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT18P05783 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT18P05783 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT18P05783 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT18P05783 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT18P05783 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT18P05783 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT18P05783 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT18P05783 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT18P05783 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT18P05783 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT18P05783 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT18P05783 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT18P05783 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT18P05783 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT18P05783 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT18P05783 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT18P05783 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT18P05783 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT18P05783 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT18P05783 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT18P05783 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT18P05783 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT18P05783 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT18P05783 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT18P05783 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT18P05783 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT18P05783 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT18P05783 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT18P05783 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
KRT18P05783 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT18P05783 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT18P05783 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT18P05783 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT18P05783 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT18P05783 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KRT18P05783 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT18P05783 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
KRT18P05783 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT18P05783 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRT18P05783 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms