Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGB1P05556 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGB1P05556 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGB1P05556 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB1P05556 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB1P05556 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB1P05556 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGB1P05556 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB1P05556 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGB1P05556 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGB1P05556 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB1P05556 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB1P05556 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGB1P05556 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGB1P05556 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGB1P05556 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB1P05556 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB1P05556 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGB1P05556 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB1P05556 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB1P05556 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB1P05556 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGB1P05556 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ITGB1P05556 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGB1P05556 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGB1P05556 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGB1P05556 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGB1P05556 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB1P05556 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB1P05556 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB1P05556 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB1P05556 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB1P05556 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB1P05556 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB1P05556 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms