Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SHBGP04278 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHBGP04278 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHBGP04278 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHBGP04278 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHBGP04278 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHBGP04278 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHBGP04278 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHBGP04278 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHBGP04278 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHBGP04278 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHBGP04278 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHBGP04278 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHBGP04278 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHBGP04278 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHBGP04278 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHBGP04278 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHBGP04278 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHBGP04278 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHBGP04278 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHBGP04278 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHBGP04278 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHBGP04278 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHBGP04278 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHBGP04278 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHBGP04278 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHBGP04278 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHBGP04278 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHBGP04278 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHBGP04278 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHBGP04278 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHBGP04278 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHBGP04278 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHBGP04278 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHBGP04278 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHBGP04278 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHBGP04278 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHBGP04278 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHBGP04278 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHBGP04278 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHBGP04278 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHBGP04278 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHBGP04278 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHBGP04278 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHBGP04278 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHBGP04278 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SHBGP04278 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHBGP04278 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHBGP04278 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHBGP04278 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHBGP04278 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHBGP04278 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHBGP04278 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHBGP04278 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHBGP04278 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHBGP04278 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHBGP04278 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHBGP04278 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHBGP04278 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHBGP04278 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHBGP04278 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHBGP04278 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHBGP04278 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHBGP04278 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SHBGP04278 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHBGP04278 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHBGP04278 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHBGP04278 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHBGP04278 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHBGP04278 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHBGP04278 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHBGP04278 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHBGP04278 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHBGP04278 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHBGP04278 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SHBGP04278 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SHBGP04278 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SHBGP04278 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHBGP04278 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHBGP04278 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SHBGP04278 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHBGP04278 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHBGP04278 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHBGP04278 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHBGP04278 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHBGP04278 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHBGP04278 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHBGP04278 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHBGP04278 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHBGP04278 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHBGP04278 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHBGP04278 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHBGP04278 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SHBGP04278 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHBGP04278 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHBGP04278 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHBGP04278 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHBGP04278 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHBGP04278 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHBGP04278 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms