Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGHG1P01857 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGHG1P01857 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IGHG1P01857 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
IGHG1P01857 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHG1P01857 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IGHG1P01857 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHG1P01857 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IGHG1P01857 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms