Protein–RNA interactions for Protein: P01116

KRAS, GTPase KRas, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRASP01116 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRASP01116 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRASP01116 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRASP01116 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRASP01116 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRASP01116 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRASP01116 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRASP01116 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRASP01116 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRASP01116 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRASP01116 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRASP01116 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRASP01116 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRASP01116 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRASP01116 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRASP01116 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KRASP01116 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRASP01116 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRASP01116 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRASP01116 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRASP01116 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KRASP01116 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRASP01116 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRASP01116 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRASP01116 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRASP01116 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRASP01116 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KRASP01116 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRASP01116 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KRASP01116 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRASP01116 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRASP01116 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRASP01116 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRASP01116 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRASP01116 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRASP01116 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRASP01116 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
KRASP01116 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRASP01116 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRASP01116 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRASP01116 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRASP01116 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRASP01116 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRASP01116 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRASP01116 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRASP01116 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRASP01116 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRASP01116 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRASP01116 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRASP01116 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRASP01116 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRASP01116 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRASP01116 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRASP01116 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRASP01116 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KRASP01116 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRASP01116 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRASP01116 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRASP01116 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KRASP01116 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRASP01116 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRASP01116 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRASP01116 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRASP01116 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRASP01116 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KRASP01116 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRASP01116 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRASP01116 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRASP01116 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KRASP01116 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRASP01116 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRASP01116 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KRASP01116 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRASP01116 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRASP01116 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KRASP01116 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRASP01116 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRASP01116 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KRASP01116 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRASP01116 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRASP01116 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KRASP01116 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRASP01116 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRASP01116 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRASP01116 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRASP01116 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KRASP01116 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRASP01116 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRASP01116 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KRASP01116 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KRASP01116 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRASP01116 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRASP01116 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KRASP01116 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KRASP01116 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KRASP01116 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KRASP01116 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRASP01116 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KRASP01116 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRASP01116 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms