Protein–RNA interactions for Protein: O95872

GPANK1, G patch domain and ankyrin repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPANK1O95872 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GPANK1O95872 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPANK1O95872 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPANK1O95872 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPANK1O95872 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPANK1O95872 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms