Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLIC3O95833 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLIC3O95833 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLIC3O95833 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC3O95833 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLIC3O95833 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC3O95833 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLIC3O95833 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLIC3O95833 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC3O95833 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC3O95833 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLIC3O95833 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLIC3O95833 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC3O95833 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC3O95833 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLIC3O95833 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLIC3O95833 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLIC3O95833 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLIC3O95833 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms