Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN9O95484 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLDN9O95484 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN9O95484 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN9O95484 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN9O95484 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN9O95484 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN9O95484 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN9O95484 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN9O95484 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN9O95484 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN9O95484 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN9O95484 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN9O95484 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN9O95484 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN9O95484 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLDN9O95484 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLDN9O95484 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLDN9O95484 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CLDN9O95484 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms