Protein–RNA interactions for Protein: O95257

GADD45G, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GO95257 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GO95257 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GO95257 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GO95257 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GO95257 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GO95257 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GO95257 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GO95257 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GO95257 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GO95257 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45GO95257 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GADD45GO95257 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GADD45GO95257 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GADD45GO95257 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GADD45GO95257 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GADD45GO95257 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45GO95257 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45GO95257 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GADD45GO95257 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GADD45GO95257 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45GO95257 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45GO95257 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GADD45GO95257 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GADD45GO95257 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GADD45GO95257 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GADD45GO95257 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GADD45GO95257 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GADD45GO95257 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GADD45GO95257 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45GO95257 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45GO95257 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GADD45GO95257 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45GO95257 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GADD45GO95257 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45GO95257 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GADD45GO95257 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GADD45GO95257 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GADD45GO95257 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GADD45GO95257 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GADD45GO95257 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms