Protein–RNA interactions for Protein: O95199

RCBTB2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCBTB2O95199 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RCBTB2O95199 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RCBTB2O95199 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RCBTB2O95199 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RCBTB2O95199 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RCBTB2O95199 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RCBTB2O95199 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms