Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPP40O75818 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RPP40O75818 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPP40O75818 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPP40O75818 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RPP40O75818 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPP40O75818 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPP40O75818 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPP40O75818 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPP40O75818 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPP40O75818 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPP40O75818 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPP40O75818 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPP40O75818 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RPP40O75818 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RPP40O75818 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPP40O75818 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPP40O75818 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPP40O75818 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPP40O75818 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPP40O75818 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPP40O75818 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RPP40O75818 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
RPP40O75818 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPP40O75818 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPP40O75818 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPP40O75818 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPP40O75818 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPP40O75818 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPP40O75818 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPP40O75818 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RPP40O75818 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPP40O75818 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPP40O75818 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RPP40O75818 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPP40O75818 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPP40O75818 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPP40O75818 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPP40O75818 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RPP40O75818 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPP40O75818 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPP40O75818 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPP40O75818 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPP40O75818 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPP40O75818 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPP40O75818 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RPP40O75818 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPP40O75818 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPP40O75818 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPP40O75818 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RPP40O75818 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPP40O75818 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPP40O75818 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPP40O75818 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPP40O75818 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPP40O75818 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPP40O75818 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPP40O75818 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPP40O75818 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPP40O75818 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPP40O75818 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPP40O75818 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPP40O75818 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RPP40O75818 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPP40O75818 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPP40O75818 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPP40O75818 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPP40O75818 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPP40O75818 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPP40O75818 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPP40O75818 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPP40O75818 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPP40O75818 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPP40O75818 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPP40O75818 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPP40O75818 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPP40O75818 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPP40O75818 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RPP40O75818 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPP40O75818 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPP40O75818 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPP40O75818 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPP40O75818 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPP40O75818 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPP40O75818 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPP40O75818 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPP40O75818 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPP40O75818 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPP40O75818 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPP40O75818 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPP40O75818 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPP40O75818 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPP40O75818 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPP40O75818 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPP40O75818 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPP40O75818 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPP40O75818 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPP40O75818 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPP40O75818 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RPP40O75818 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms