Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP3O75386 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP3O75386 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP3O75386 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP3O75386 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP3O75386 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP3O75386 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP3O75386 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP3O75386 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP3O75386 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP3O75386 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP3O75386 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP3O75386 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TULP3O75386 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP3O75386 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP3O75386 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP3O75386 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP3O75386 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TULP3O75386 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP3O75386 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP3O75386 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TULP3O75386 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP3O75386 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP3O75386 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TULP3O75386 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP3O75386 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TULP3O75386 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP3O75386 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP3O75386 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TULP3O75386 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP3O75386 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP3O75386 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP3O75386 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP3O75386 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TULP3O75386 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP3O75386 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TULP3O75386 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TULP3O75386 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TULP3O75386 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TULP3O75386 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TULP3O75386 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TULP3O75386 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP3O75386 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP3O75386 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP3O75386 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TULP3O75386 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP3O75386 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TULP3O75386 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP3O75386 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP3O75386 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP3O75386 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TULP3O75386 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP3O75386 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP3O75386 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP3O75386 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TULP3O75386 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TULP3O75386 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP3O75386 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP3O75386 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP3O75386 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP3O75386 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP3O75386 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TULP3O75386 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP3O75386 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP3O75386 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TULP3O75386 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TULP3O75386 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TULP3O75386 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP3O75386 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP3O75386 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP3O75386 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP3O75386 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP3O75386 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TULP3O75386 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TULP3O75386 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP3O75386 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP3O75386 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP3O75386 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TULP3O75386 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP3O75386 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TULP3O75386 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TULP3O75386 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP3O75386 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP3O75386 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP3O75386 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP3O75386 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP3O75386 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP3O75386 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP3O75386 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP3O75386 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP3O75386 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP3O75386 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP3O75386 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP3O75386 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TULP3O75386 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TULP3O75386 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP3O75386 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP3O75386 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TULP3O75386 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TULP3O75386 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms