Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PITX3O75364 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PITX3O75364 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX3O75364 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PITX3O75364 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX3O75364 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX3O75364 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PITX3O75364 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PITX3O75364 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX3O75364 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX3O75364 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX3O75364 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX3O75364 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX3O75364 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX3O75364 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PITX3O75364 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX3O75364 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PITX3O75364 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX3O75364 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PITX3O75364 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PITX3O75364 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX3O75364 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX3O75364 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PITX3O75364 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITX3O75364 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PITX3O75364 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PITX3O75364 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX3O75364 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX3O75364 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX3O75364 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PITX3O75364 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX3O75364 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX3O75364 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX3O75364 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX3O75364 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PITX3O75364 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX3O75364 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX3O75364 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PITX3O75364 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX3O75364 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PITX3O75364 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX3O75364 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX3O75364 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX3O75364 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX3O75364 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PITX3O75364 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX3O75364 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX3O75364 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PITX3O75364 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX3O75364 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX3O75364 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX3O75364 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX3O75364 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX3O75364 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PITX3O75364 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PITX3O75364 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX3O75364 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX3O75364 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX3O75364 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX3O75364 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX3O75364 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PITX3O75364 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITX3O75364 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITX3O75364 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PITX3O75364 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX3O75364 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX3O75364 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PITX3O75364 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX3O75364 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX3O75364 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX3O75364 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX3O75364 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX3O75364 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PITX3O75364 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PITX3O75364 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX3O75364 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PITX3O75364 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX3O75364 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX3O75364 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX3O75364 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX3O75364 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX3O75364 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX3O75364 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PITX3O75364 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX3O75364 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX3O75364 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PITX3O75364 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX3O75364 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX3O75364 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX3O75364 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX3O75364 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX3O75364 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PITX3O75364 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX3O75364 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PITX3O75364 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX3O75364 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PITX3O75364 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PITX3O75364 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX3O75364 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PITX3O75364 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms