Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PPFIA3O75145 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PPFIA3O75145 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPFIA3O75145 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPFIA3O75145 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PPFIA3O75145 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PPFIA3O75145 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PPFIA3O75145 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms