Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NOL3O60936 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NOL3O60936 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOL3O60936 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOL3O60936 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOL3O60936 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOL3O60936 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOL3O60936 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NOL3O60936 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOL3O60936 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NOL3O60936 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOL3O60936 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOL3O60936 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOL3O60936 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOL3O60936 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOL3O60936 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOL3O60936 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOL3O60936 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOL3O60936 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOL3O60936 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOL3O60936 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOL3O60936 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOL3O60936 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOL3O60936 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOL3O60936 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOL3O60936 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOL3O60936 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOL3O60936 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOL3O60936 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOL3O60936 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOL3O60936 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NOL3O60936 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOL3O60936 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOL3O60936 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOL3O60936 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOL3O60936 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOL3O60936 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOL3O60936 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOL3O60936 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOL3O60936 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOL3O60936 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOL3O60936 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOL3O60936 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOL3O60936 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOL3O60936 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOL3O60936 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOL3O60936 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOL3O60936 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOL3O60936 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOL3O60936 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOL3O60936 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOL3O60936 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOL3O60936 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOL3O60936 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOL3O60936 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOL3O60936 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOL3O60936 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOL3O60936 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOL3O60936 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOL3O60936 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOL3O60936 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOL3O60936 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOL3O60936 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOL3O60936 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOL3O60936 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOL3O60936 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOL3O60936 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOL3O60936 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOL3O60936 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOL3O60936 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOL3O60936 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOL3O60936 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOL3O60936 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOL3O60936 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOL3O60936 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOL3O60936 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOL3O60936 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NOL3O60936 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOL3O60936 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOL3O60936 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOL3O60936 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOL3O60936 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOL3O60936 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOL3O60936 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOL3O60936 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOL3O60936 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOL3O60936 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOL3O60936 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOL3O60936 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOL3O60936 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOL3O60936 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOL3O60936 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOL3O60936 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOL3O60936 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOL3O60936 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOL3O60936 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOL3O60936 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NOL3O60936 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOL3O60936 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NOL3O60936 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms