Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC22O60826 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC22O60826 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC22O60826 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC22O60826 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC22O60826 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC22O60826 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC22O60826 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC22O60826 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC22O60826 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC22O60826 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC22O60826 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC22O60826 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC22O60826 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC22O60826 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC22O60826 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC22O60826 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC22O60826 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC22O60826 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC22O60826 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC22O60826 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC22O60826 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC22O60826 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC22O60826 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC22O60826 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC22O60826 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC22O60826 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC22O60826 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC22O60826 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC22O60826 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC22O60826 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC22O60826 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms