Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF2O60811 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF2O60811 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF2O60811 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF2O60811 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF2O60811 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF2O60811 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms