Protein–RNA interactions for Protein: O60688

YPEL1, Protein yippee-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL1O60688 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
YPEL1O60688 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
YPEL1O60688 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
YPEL1O60688 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
YPEL1O60688 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YPEL1O60688 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YPEL1O60688 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YPEL1O60688 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YPEL1O60688 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
YPEL1O60688 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YPEL1O60688 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.32■■□□□ 1
YPEL1O60688 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms