Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKNO60260 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKNO60260 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRKNO60260 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKNO60260 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKNO60260 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKNO60260 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKNO60260 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRKNO60260 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKNO60260 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKNO60260 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKNO60260 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKNO60260 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKNO60260 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRKNO60260 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKNO60260 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKNO60260 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKNO60260 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKNO60260 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKNO60260 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKNO60260 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKNO60260 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKNO60260 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKNO60260 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKNO60260 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKNO60260 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKNO60260 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKNO60260 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKNO60260 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKNO60260 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKNO60260 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKNO60260 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKNO60260 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKNO60260 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRKNO60260 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKNO60260 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKNO60260 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKNO60260 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKNO60260 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKNO60260 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKNO60260 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKNO60260 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKNO60260 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKNO60260 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKNO60260 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKNO60260 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKNO60260 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKNO60260 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKNO60260 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKNO60260 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKNO60260 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKNO60260 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKNO60260 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKNO60260 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKNO60260 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKNO60260 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKNO60260 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKNO60260 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKNO60260 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKNO60260 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKNO60260 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKNO60260 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKNO60260 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKNO60260 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKNO60260 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKNO60260 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKNO60260 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKNO60260 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKNO60260 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKNO60260 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKNO60260 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKNO60260 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKNO60260 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKNO60260 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKNO60260 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKNO60260 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKNO60260 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKNO60260 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKNO60260 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKNO60260 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKNO60260 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKNO60260 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRKNO60260 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKNO60260 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKNO60260 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKNO60260 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKNO60260 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRKNO60260 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKNO60260 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKNO60260 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKNO60260 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRKNO60260 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKNO60260 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKNO60260 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKNO60260 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRKNO60260 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKNO60260 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRKNO60260 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRKNO60260 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRKNO60260 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms