Protein–RNA interactions for Protein: O60229

KALRN, Kalirin, humanhuman

Predictions only

Length 2,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KALRNO60229 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KALRNO60229 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KALRNO60229 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KALRNO60229 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KALRNO60229 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KALRNO60229 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KALRNO60229 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KALRNO60229 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KALRNO60229 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KALRNO60229 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KALRNO60229 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KALRNO60229 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KALRNO60229 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KALRNO60229 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KALRNO60229 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KALRNO60229 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KALRNO60229 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KALRNO60229 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KALRNO60229 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KALRNO60229 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KALRNO60229 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KALRNO60229 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KALRNO60229 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KALRNO60229 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KALRNO60229 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KALRNO60229 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KALRNO60229 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KALRNO60229 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KALRNO60229 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KALRNO60229 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KALRNO60229 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KALRNO60229 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KALRNO60229 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KALRNO60229 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KALRNO60229 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KALRNO60229 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KALRNO60229 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KALRNO60229 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KALRNO60229 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KALRNO60229 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KALRNO60229 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KALRNO60229 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KALRNO60229 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KALRNO60229 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KALRNO60229 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KALRNO60229 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KALRNO60229 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KALRNO60229 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KALRNO60229 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KALRNO60229 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KALRNO60229 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KALRNO60229 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KALRNO60229 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KALRNO60229 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KALRNO60229 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KALRNO60229 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KALRNO60229 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KALRNO60229 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KALRNO60229 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KALRNO60229 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KALRNO60229 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KALRNO60229 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KALRNO60229 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KALRNO60229 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KALRNO60229 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KALRNO60229 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KALRNO60229 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KALRNO60229 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KALRNO60229 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KALRNO60229 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KALRNO60229 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KALRNO60229 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KALRNO60229 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KALRNO60229 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KALRNO60229 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KALRNO60229 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KALRNO60229 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KALRNO60229 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KALRNO60229 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KALRNO60229 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KALRNO60229 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KALRNO60229 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KALRNO60229 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KALRNO60229 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KALRNO60229 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KALRNO60229 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KALRNO60229 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KALRNO60229 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KALRNO60229 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KALRNO60229 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KALRNO60229 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KALRNO60229 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KALRNO60229 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KALRNO60229 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KALRNO60229 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KALRNO60229 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KALRNO60229 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KALRNO60229 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KALRNO60229 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KALRNO60229 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms