Protein–RNA interactions for Protein: O60224

SSX4, Protein SSX4, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX4O60224 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX4O60224 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX4O60224 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX4O60224 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSX4O60224 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSX4O60224 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX4O60224 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX4O60224 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX4O60224 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX4O60224 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX4O60224 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX4O60224 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX4O60224 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSX4O60224 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX4O60224 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX4O60224 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX4O60224 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX4O60224 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX4O60224 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX4O60224 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSX4O60224 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSX4O60224 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSX4O60224 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX4O60224 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX4O60224 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX4O60224 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX4O60224 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX4O60224 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX4O60224 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX4O60224 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX4O60224 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX4O60224 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX4O60224 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX4O60224 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX4O60224 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSX4O60224 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX4O60224 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX4O60224 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSX4O60224 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX4O60224 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX4O60224 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX4O60224 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX4O60224 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSX4O60224 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX4O60224 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX4O60224 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSX4O60224 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX4O60224 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX4O60224 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX4O60224 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX4O60224 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSX4O60224 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SSX4O60224 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSX4O60224 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX4O60224 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX4O60224 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSX4O60224 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX4O60224 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSX4O60224 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX4O60224 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX4O60224 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX4O60224 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSX4O60224 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX4O60224 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX4O60224 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSX4O60224 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX4O60224 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX4O60224 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX4O60224 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSX4O60224 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX4O60224 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX4O60224 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX4O60224 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX4O60224 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSX4O60224 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX4O60224 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX4O60224 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX4O60224 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX4O60224 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX4O60224 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSX4O60224 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX4O60224 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX4O60224 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX4O60224 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX4O60224 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SSX4O60224 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX4O60224 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX4O60224 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX4O60224 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX4O60224 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSX4O60224 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX4O60224 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX4O60224 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX4O60224 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSX4O60224 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSX4O60224 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX4O60224 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX4O60224 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX4O60224 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSX4O60224 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms