Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITM2AO43736 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ITM2AO43736 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITM2AO43736 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITM2AO43736 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ITM2AO43736 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITM2AO43736 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITM2AO43736 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITM2AO43736 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ITM2AO43736 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ITM2AO43736 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ITM2AO43736 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITM2AO43736 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITM2AO43736 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITM2AO43736 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ITM2AO43736 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ITM2AO43736 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms